MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-285

Total Repeats: 6738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020384	T	6	6	57	62	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020384	ACAAA	2	10	88	97	80 %	0 %	0 %	20 %	452195885
3	NC_020384	A	6	6	95	100	100 %	0 %	0 %	0 %	452195885
4	NC_020384	TCA	2	6	134	139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452195885
5	NC_020384	ATTTG	2	10	140	149	20 %	60 %	20 %	0 %	452195885
6	NC_020384	TGC	2	6	199	204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452195885
7	NC_020384	AATA	2	8	330	337	75 %	25 %	0 %	0 %	452195885
8	NC_020384	GGT	2	6	375	380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020384	GTAT	2	8	383	390	25 %	50 %	25 %	0 %	452195886
10	NC_020384	A	6	6	451	456	100 %	0 %	0 %	0 %	452195886
11	NC_020384	ATAA	2	8	481	488	75 %	25 %	0 %	0 %	452195886
12	NC_020384	A	6	6	567	572	100 %	0 %	0 %	0 %	452195886
13	NC_020384	TCT	2	6	641	646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452195886
14	NC_020384	TGA	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452195886
15	NC_020384	GAAA	2	8	840	847	75 %	0 %	25 %	0 %	452195886
16	NC_020384	TGG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452195886
17	NC_020384	ATA	2	6	1028	1033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452195886
18	NC_020384	GAACA	2	10	1058	1067	60 %	0 %	20 %	20 %	452195886
19	NC_020384	GAA	2	6	1228	1233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452195886
20	NC_020384	TCA	2	6	1281	1286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452195886
21	NC_020384	AT	3	6	1498	1503	50 %	50 %	0 %	0 %	452195886
22	NC_020384	ACA	2	6	1530	1535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452195886
23	NC_020384	AGA	2	6	1566	1571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452195886
24	NC_020384	A	6	6	1579	1584	100 %	0 %	0 %	0 %	452195886
25	NC_020384	TA	3	6	1661	1666	50 %	50 %	0 %	0 %	452195886
26	NC_020384	GAA	2	6	1672	1677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452195886
27	NC_020384	CAA	2	6	1685	1690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452195887
28	NC_020384	AAC	2	6	1693	1698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452195887
29	NC_020384	TTAAAA	2	12	1712	1723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452195887
30	NC_020384	TAA	2	6	1765	1770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452195887
31	NC_020384	ATTC	2	8	1841	1848	25 %	50 %	0 %	25 %	452195887
32	NC_020384	AGG	2	6	1881	1886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452195887
33	NC_020384	TGA	2	6	1888	1893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452195887
34	NC_020384	TAA	2	6	1921	1926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452195887
35	NC_020384	ACA	2	6	1927	1932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452195887
36	NC_020384	CAA	2	6	1967	1972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452195887
37	NC_020384	GTG	2	6	1998	2003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452195887
38	NC_020384	AGC	3	9	2038	2046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452195887
39	NC_020384	TTATT	2	10	2065	2074	20 %	80 %	0 %	0 %	452195887
40	NC_020384	TTA	2	6	2166	2171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452195887
41	NC_020384	TGA	2	6	2173	2178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452195887
42	NC_020384	GGA	2	6	2203	2208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452195887
43	NC_020384	ATT	2	6	2215	2220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452195887
44	NC_020384	GTA	2	6	2253	2258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452195887
45	NC_020384	CAT	2	6	2348	2353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452195887
46	NC_020384	GGT	2	6	2359	2364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452195887
47	NC_020384	TGAT	2	8	2416	2423	25 %	50 %	25 %	0 %	452195887
48	NC_020384	CA	4	8	2484	2491	50 %	0 %	0 %	50 %	452195888
49	NC_020384	AAAG	2	8	2519	2526	75 %	0 %	25 %	0 %	452195888
50	NC_020384	TCA	2	6	2576	2581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452195888
51	NC_020384	T	6	6	2593	2598	0 %	100 %	0 %	0 %	452195888
52	NC_020384	CTT	2	6	2751	2756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452195888
53	NC_020384	CATG	2	8	2763	2770	25 %	25 %	25 %	25 %	452195888
54	NC_020384	ATT	2	6	2862	2867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020384	TGA	2	6	2903	2908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020384	CATAT	2	10	2926	2935	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_020384	TTC	2	6	2984	2989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020384	TAA	2	6	3033	3038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020384	CAT	2	6	3063	3068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020384	T	7	7	3079	3085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020384	ACT	2	6	3111	3116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020384	TCC	3	9	3121	3129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_020384	TTA	2	6	3163	3168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020384	CAA	2	6	3173	3178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020384	CA	3	6	3195	3200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_020384	TGA	2	6	3219	3224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020384	AAAAAG	2	12	3288	3299	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020384	T	6	6	3337	3342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020384	T	6	6	3410	3415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020384	ATT	2	6	3464	3469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020384	GA	3	6	3470	3475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020384	ATT	2	6	3495	3500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020384	ATACA	2	10	3560	3569	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_020384	A	6	6	3569	3574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020384	TTG	2	6	3656	3661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020384	T	6	6	3671	3676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020384	AT	3	6	3706	3711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020384	A	8	8	3735	3742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020384	ATTT	2	8	3750	3757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020384	AAT	2	6	3803	3808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020384	ATT	2	6	3869	3874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020384	TTG	2	6	3905	3910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020384	TAAT	2	8	3985	3992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020384	ATT	2	6	3998	4003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020384	ATATT	2	10	4029	4038	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020384	T	6	6	4037	4042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020384	TA	3	6	4207	4212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020384	T	6	6	4281	4286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020384	A	7	7	4295	4301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020384	TAA	2	6	4305	4310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020384	TA	3	6	4313	4318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020384	AT	9	18	4336	4353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020384	CAA	2	6	4365	4370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020384	GAG	2	6	4371	4376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020384	AAT	2	6	4380	4385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020384	AG	3	6	4407	4412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020384	GTT	2	6	4560	4565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020384	ATC	2	6	4574	4579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020384	AAAAAG	2	12	4592	4603	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020384	ATAA	2	8	4623	4630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020384	ATT	2	6	4650	4655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020384	AT	3	6	4660	4665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020384	A	6	6	4707	4712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020384	TTTG	2	8	4730	4737	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020384	ATC	2	6	4748	4753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020384	TTA	2	6	4769	4774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020384	T	7	7	4786	4792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020384	TA	3	6	4809	4814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020384	TAAT	2	8	4820	4827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020384	GAA	2	6	4838	4843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020384	TAA	2	6	4872	4877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020384	TTG	2	6	4880	4885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020384	T	6	6	4897	4902	0 %	100 %	0 %	0 %	452195889
114	NC_020384	TCA	2	6	5051	5056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452195889
115	NC_020384	CAT	2	6	5143	5148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_020384	ATT	2	6	5159	5164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020384	T	6	6	5175	5180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020384	TTC	2	6	5194	5199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_020384	ATC	2	6	5228	5233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_020384	TAAT	2	8	5251	5258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020384	T	6	6	5270	5275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020384	TA	3	6	5288	5293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020384	GAAA	2	8	5302	5309	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020384	TAAAT	2	10	5340	5349	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020384	ATA	2	6	5449	5454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020384	T	6	6	5480	5485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020384	CTA	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020384	ATT	2	6	5505	5510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452195890
129	NC_020384	TCT	2	6	5513	5518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452195890
130	NC_020384	T	6	6	5518	5523	0 %	100 %	0 %	0 %	452195890
131	NC_020384	GAA	2	6	5635	5640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452195890
132	NC_020384	ATATC	2	10	5679	5688	40 %	40 %	0 %	20 %	452195890
133	NC_020384	CTA	2	6	5706	5711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452195890
134	NC_020384	GAA	2	6	5712	5717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452195890
135	NC_020384	GCA	2	6	5783	5788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452195890
136	NC_020384	TAA	2	6	5836	5841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452195890
137	NC_020384	ACC	2	6	5875	5880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452195890
138	NC_020384	CTA	2	6	5944	5949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_020384	TAT	2	6	5950	5955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020384	CATG	2	8	5976	5983	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_020384	T	7	7	6043	6049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020384	TAAA	2	8	6110	6117	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020384	AT	3	6	6121	6126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020384	AT	3	6	6135	6140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020384	AAT	2	6	6162	6167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020384	T	6	6	6184	6189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020384	AT	3	6	6194	6199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020384	TTAG	2	8	6251	6258	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_020384	TA	3	6	6310	6315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020384	T	6	6	6331	6336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020384	TTA	2	6	6353	6358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_020384	T	6	6	7482	7487	0 %	100 %	0 %	0 %	452195891
187	NC_020384	T	6	6	7559	7564	0 %	100 %	0 %	0 %	452195891
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284	NC_020384	A	6	6	11269	11274	100 %	0 %	0 %	0 %	452195896
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287	NC_020384	ACC	2	6	11342	11347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452195896
288	NC_020384	AAT	2	6	11357	11362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452195896
289	NC_020384	AAT	2	6	11411	11416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_020384	AATA	2	8	11504	11511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_020384	CTT	2	6	11593	11598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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428	NC_020384	TA	3	6	16743	16748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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